因为偷税事件,曾经处于精英组的百合根友久(冈田将生 饰)被踢到早先成立的科学搜查班(ST)担任指挥官,通过之前的合作,虽然百合根始终未能完全接受青山翔(志田未来 饰)、结城翠(芦名星 饰)、黑崎勇治(漥田正孝 饰)、山吹才藏(三宅弘城 饰)以及ST实际领导者赤城左门(藤原龙也 饰)这群怪人的行径,却也为他们自身那极度专业和见斥于周遭的气息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一课,一面又打算多守护ST的各位一段时间。随着作为后盾的三枝警官(渡部笃郎 饰)的离开和ST新任监查松户紫织(濑户朝香 饰)的到来,ST面临生死存亡的危机。赤门渐渐走出家门,百合根则成为遏止这头怪物不可或缺的重要存在……